中枢神经系统位置固定，不受呼吸运动、胃肠蠕动的影像，故MRI以中枢神经系统效果最佳。MRI的多方位、多参数、多轴倾斜切层对中枢神经系统病变的定位定性诊断极其优越。颅脑MRI检查无颅骨伪影，脑灰白质信号对比度高，使得颅脑MRI检查明显优于CT。尤其在早期脑梗塞的诊断方面是目前世界上最好的方法。

头部MRI检查的适应症：

脑肿瘤。多方向切层有利于定位，无骨及气体伪影。尤其在颅底后颅窝、脑干病变优势更明显。多种扫描技术结合对良、恶性肿瘤的鉴别及肿瘤的分级分期有明显的优势。

脑血管疾病。急性脑出血首选CT，主要是由于CT扫描速比MR快：亚急性脑出血首选MRI：脑梗塞明显优于CT，发现早、不容易漏病灶，DWI（弥散加权成像）极具特异性。脑血管畸形、动静脉畸形、动脉瘤明显优于CT，我院可不增强对血管性病变进行三维观察。

脑白质病变。脱髓鞘疾病、变性疾病明显优于CT。如皮层下动脉硬化性脑病、多发性硬化症等。

脑外伤。脑挫伤、脑挫裂伤明显优于CT。磁共振的DWI和SWI技术对弥散性轴索损伤的显示有绝对优势，颅骨骨折和超急性脑出血不如CT。

感染性疾病明显优于CT，如脑脓肿、脑炎、脑结核、脑囊虫等。

脑室及蛛网膜下腔病变。如脑室内肿瘤、脑积水等。

先天性疾病。如灰质异位、巨脑回等发育畸形。

颅底、后颅凹病变优势更加明显，如垂体病变，听神经病变，脑干病变等。总之，除急性外伤、超急性脑出血外，颅脑部影像检查均应首选MRI。